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科學(xué)家破譯枸杞子基因組圖譜

發(fā)布日期:2024/12/30 12:07:08 點擊數(shù):398

        中國科學(xué)院院士、生物物理研究所研究員陳潤生研究組與研究員陳暢研究組,在《基因組蛋白質(zhì)組與生物信息學(xué)報》(Genomics,?Proteomics & Bioinformatics)上發(fā)表了題為Enzymes Repertoires and Genomic Insights into Lycium Barbarum Pectin Polysaccharides Biosynthesis的研究論文。該研究解析了枸杞基因組圖譜及活性成分,揭示了LBPPs的完整生物合成途徑,并鑒定了關(guān)鍵合成酶及糖代謝調(diào)控相關(guān)的RNA。該研究基于三代測序技術(shù)、光學(xué)圖譜技術(shù)、自研高效三維基因組捕獲技術(shù)等方法,對枸杞進行de novo的基因組組裝,突破枸杞基因組高雜合、高重復(fù)的瓶頸,獲得枸杞高精度基因組圖譜。在此基礎(chǔ)上,研究解析了多糖活性酶基因庫CAZymes在LBPPs合成中的核心作用,尤其是在枸杞果膠多糖骨架延伸、側(cè)鏈合成和鏈修飾等方面的累積擴張。進一步,研究鑒定了一個關(guān)鍵鼠李糖糖基轉(zhuǎn)移酶基因RRT3020。研究顯示,RRT3020能夠顯著促進枸杞果膠多糖生成。同時,該研究解析了與枸杞果膠多糖代謝相關(guān)的長鏈非編碼RNA,為剖析基因調(diào)控提供了新視角。該研究在枸杞中建立了全面的果膠多糖合成模型,揭示了從糖轉(zhuǎn)運到多糖修飾的整個合成過程。

 
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